印尼的税收体系分为中央税和地方税两种主要税制。虽然税收立法权和征收权主要集中在中央政府，但地方政府也拥有一定的权力来制定一部分地方税规范。主要税种包括企业所得税、个人所得税、预提税、增值税和奢侈品销售税、财产税、印花税、娱乐税、广告税、地下水税、机动车税以及其他税种等。不同地方政府所制定的地方税存在一些差异。印尼根据“属地性原则”行使其税务管辖权，但对居民纳税人要求“全球课税”。
印尼税务总署是财政部下属的负责税收征管的机构，由中央办公室和运营办公室组成。
印尼的主要税法包括《税法总则》（2007年第28号）、《所得税法》（2008年第36号）和《增值税法》（2009年第42号）。为吸引外国投资，印尼政府2020年出台了《综合性创造就业法》（2020年第11号，简称《综合法》），对这些法律进行了补充更新，新增了一些外国投资的优惠政策。
为了吸引外资投资，印尼政府颁布了2020年第96号以及第130号财政部令，用以鼓励投资的免税和税收补贴等优惠政策也详细规定了针对经济特区和其他进口税收优惠政策的政策，可以向投资部（投资协调委员会，BKPM）申请这些税收优惠政策。投资者需要于申请到税收优惠之后一年之内实现他们的投资承诺。
印尼财政部在2020年颁布了第11号法令给予特定地区以及特定行业的企业所得税优惠政策。
2008年颁布的第36号新《所得税法》规定，个人所得税最高税率从35%降为30%，分为四档，5000万盾以下，税率5%；5000万盾至2.5亿盾，税率15%；2.5亿盾至5亿盾，税率25%；5亿盾以上者，税率30%。个人取得的股息分红的最终税率为10%，但如果个人取得的股息分红在3年内再投资到印尼，则可以降低其最终税率为0。
依据2008年第36号法令以及2020年第1号政府条例，2020年以前的企业所得税率为25%，2020年至2021年使用过渡期企业所得税率22%。上市公司在满足特定条件的情况下，可享受减免额外3%的所得税优惠。对于中、小、微型企业提供所得税鼓励措施，营收低于48亿印尼盾的小、微型有限责任公司，运营的前3个财年使用固定税率，即按照营业额的0.5%征税，此后依照常规企业所得税制，但减免50%的企业所得税。中型企业，对于其营收48亿印尼盾以下的利润减免50%的企业所得税，对于营收超过48亿印尼盾收入利润减免0-50%之间的阶梯式企业所得税，直至营收达到500亿印尼盾，征收全额企业所得税。
对于特定行业，印尼制定了以公司营业额作为税基而征收的最终企业所得税。各特定行业采用的税率各不相同，如工程行业依据不同类型的执照征收2%/3%/4%/6%，海运1.2%，空运1.8%，房地产交易2.5%，租赁10%等不同的税率。其关于特定行业营收部分所征收的“最终企业所得税”可替代“常规企业所得税”部分的纳税义务，不会双重征收。
2021年10月，印尼政府批准《税收法规协调法》，将增值税设定了单一税率，并将分阶段上调，不迟于2025年1月1日将上调至12%。法律中也规定更广泛的社区和医疗服务所需的基本商品可以免征增值税。2022年3月，印尼财政部税务总局根据《税收法规协调法》，将增值税标准税率上调至11%，2022年4月1日起生效。
除增值税外，印尼对于属于应税分类的奢侈品销售或进口征收奢侈品销售税。对出口货物不征奢侈品销售税。奢侈品销售税的计税基础与增值税一致，为销售价格、进口价格、出口价格以及其他法规规定的价格。该税仅在生产环节及进口环节一次性征收。
基于2020年第10号关于印花税的法规，印花税是对一些合同及其他文件的签署征收10000印尼盾的税种。针对民事法律行为或作为法院正式证据的文件，以及价值超过500万盾的任何类型协议都要求贴上印花税票。
2021年5月，印尼税务总局（DJP）对8家国际公司的数字产品征收10%的增值税，包括Hotels.com L.P、Epic Games International S.a,r.l.等。目前，税务总局指定的需征缴增值税的数字公司有75家，包括Netflix、Shopee、Zoom和阿里云等。
2021年5月，印尼政府表示计划征收碳排放税。目前，正就1983年第6号法律（税法）进行修订，草案文本显示政府将向购买含碳商品或开展存在碳排放活动的个人或公司征收碳税，税率为每公斤碳排放当量75印尼盾。
2021年6月，印尼支持对国际税收规则进行全面改革，该方案将使跨国公司在其经营所在的国家缴纳更多税款，同时最低全球企业税率至少为15%。
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